APLIKASI METODE KLASIFIKASI K-NEAREST NEIGHBOR (KNN) PADA DATA GENE EXPRESSION MAIZE Nested Association Mapping (Studi Kasus : Klasifikasi Organ MAIZE Nested Association Mapping (NAM))

Abstract

Jagung merupakan tanaman yang memiliki nilai ekonomi tinggi. Salah satu cara yang digunakan untuk meningkatkan produksi jagung yaitu dengan menerapkan teknik Nested Association Mapping (NAM). Teknik NAM dirancang untuk mengidentifikasi dan membedah arsitektur genetik ciri-ciri kompleks dalam jagung (Zea mays). Data ekspresi gen dalam jumlah yang besar memberikan tantangan dalam mengaplikasikan metode analisis, menginterpretasi, dan mengambil kesimpulan. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi hasil klasifikasi gene expression pada varietas jagung mengenai klasifikasi organ-organ nya, yaitu Apex, Root, Shoot, Ear, dan Tassel dengan menggunakan K-Nearest Neighbor (KNN). Berdasarkan analisis KNN dengan k=5 diperoleh nilai akurasi dan nilai AUC masing masing sebesar 0. 926 dan sebesar 0.992. Hal ini menunjukkan klasifikasi gene expressions pada varietas jagung untuk membedakan organ Apex, root, shoot, ear, dan tassel dapat dipercaya.