| dc.description.abstract | Pneumonia merupakan salah satu penyakit infeksi saluran pernapasan yang
memiliki dinamika respon molekuler yang kompleks dan dapat berbeda tergantung
jenis patogen penyebabnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi gen
yang terekspresi berbeda serta pola interaksi gen pada pneumonia akibat infeksi
bakteri Streptococcus pneumoniae dan virus Influenza A Virus (IAV)
menggunakan data transkriptomik berbasis microarray dan Next Generation
Sequencing(NGS). Data diperoleh dari basis data publik Gene Expression
Omnibus (GEO) dan dianalisis menggunakan pendekatan deret waktu. Tahapan
penelitian meliputi praproses data sesuai karakteristik masing-masing platform,
analisis Differentially Expressed Genes (DEGs), analisis jaringan Protein-Protein
Interaction (PPI), identifikasi modul gen menggunakan MCODE, serta
analisis Gene Ontology (GO) dan Kyoto Encyclopedia of Genes and
Genomes (KEGG). Analisis dilakukan menggunakan perangkat lunak R dan
Cytoscape. Hasil penelitian menunjukkan bahwa infeksi S. pneumoniae cenderung
memicu respon imun bawaan, aktivasi jalur interferon, serta perubahan
metabolisme seluler yang berkaitan dengan detoksifikasi. Sementara itu, infeksi
IAV menunjukkan dominasi respon antiviral, amplifikasi inflamasi, serta regulasi
komunikasi antar sel imun. Perbedaan pola ekspresi gen dan jalur biologis pada
kedua patogen menunjukkan bahwa respon molekuler mus musculus terhadap
pneumonia bersifat dinamis dan spesifik terhadap jenis patogen penyebab infeksi.
Temuan ini diharapkan dapat menjadi dasar bagi penelitian lanjutan terkait
biomarker maupun target terapeutik pada pneumonia. | en_US |
