IMPLEMENTASI ALGORITMA SPECTRAL BICLUSTERING PADA DATA EKSPRESI GEN (Studi Kasus : Data Pasien Pada Studi “Gene Expression Change in Blood During Etanol Exposure ” / GSE 20486)

Abstract

Etanol (alcohol) adalah nama suatu golongan senyawa organik yang mengandung unsur C,H dan O. Etanol dalam ilmu kimia disebut juga sebagai etil alkohol dengan rumus senyawa C2H5OH. Badan Narkotika Nasional (BNN) memperkirakan ada 3,2 juta orang (1,5% dari total populasi) di Indonesia mempunyai riwayat menggunakan NAPZA diantaranya 46% adalah perilaku minum alcohol. Dampak dari perilaku minum alcohol salah satunya adalah mabuk, pengendara mabuk merupakan faktor yang beresiko menyebabkan kecelakaan lalu lintas, yang menyebabkan kejadian meninggal dunia. Dalam kasus yang lain tahun 1994-2000 sekitar 11,5% kecelakaan penerbangan umum berhubungan dengan alkohol terkait dengan pilot yang memiliki riwayat DWI (mengemudi sambil mabuk). Penelitian ini adalah untuk mengetahui pengelompokan karateristik pengaruh dalam tingkat ekspresi gen yang terpapar etanol dengan Spectral Biclustering, menggunakan RNA yang diekstraksi dari seluruh darah, ketika etanol memasuki sistem darah. Dengan analisis microarray. Hasil dari analisis didapatkan 5 bicluster dari 54 sampel dan 201 gen dengan nilai rata-rata ekspresi gen terbesar adalah X213350_at yang berada pada bicluster 4.